La Unidad de Genómica-Citometría de Flujo es uno de los servicios centrales del Centro de Apoyo Tecnológico (CAT) de la URJC. Tiene como objetivo ofrecer tanto a grupos de investigación de la propia URJC como a otros usuarios externos un apoyo en sus proyectos de investigación dentro del campo de la Genómica. El acceso a la solicitud de servicios de la Unidad se hace a través de la herramienta informática Servilims que se podrá encontrar en la página web del CAT.
Secuenciación, de ADN, genotipado y detección de mutaciones mediante el análisis de fragmentos de ADN amplificados por PCR y marcados con fluorescencia por electroforesis capilar. Estudios epigenéticos por Secuenciación de DNA modificado por bisulfito.
Cuantificación de la expresión génica, cuantificación absoluta de ADN (microorganismos en muestras biológicas, dosis génica) y genotipado (detección de polimorfismos de un nucleótido).
Cuantificación de la expresión génica, cuantificación absoluta de ADN (microorganismos en muestras biológicas, dosis génica) y genotipado (detección de polimorfismos de un nucleótido).
Sistema para la medición cualitativa y cuantitativa de las propiedades biológicas y físicas de células y otras partículas microscópicas cuando estas se las hace pasar, de una en una, a través del haz de un láser. 2 láseres y 5 parámetros de Fluorescencia.
Análisis y separación física de células por citometría de flujo. Permite depositar las células (incluso célula única) en tubo o placa. 3 láseres y 8 parámetros de fluorescencia.
Sistema de escaneado y análisis de fluorescencia y quimioluminiscencia.
Permite la detección simultánea de hasta 4 colores diferentes.
Equipo para toma de imágenes de fluorescencia y quimioluminiscencia en geles y membranas y posterior análisis de estas imágenes
El FLUOstar® Omega es un lector de microplacas con seis modos de detección: intensidad de fluorescencia (incluyendo FRET), luminiscencia (incluyendo BRET), absorbancia UV/Vis, fluorescencia en tiempo resuelto (incluyendo TR-FRET), y AlphaScreen®/AlphaLISA®. Utiliza un espectrómetro ultravioleta ultravioleta / vis o filtros para la absorbancia, así como filtros altamente sensibles para todos los demás modos de detección.
Espectrofotómetro que permite trabajar con volúmenes muy pequeños de muestra, de hasta 1,5 microlitros.
Determinación de la concentración de DNA, RNA y proteínas.
Permite la detección de contaminantes en la muestra.
Equipamiento para determinar concentración precisa e integridad de RNA, DNA y proteínas por reacciones fluorimétricas y electroforesis en gel altamente sensible.
Publicaciones más relevantes en las que se ha hecho uso de los servicios de la Unidad de Genómica-Citometría:
1. Authors: CM Molina, N González, F. Bautista, R. Sanz, R Simarro, J. L. Sanz, i. Sanz
Title: Isolation and genetic identification of PAH degrading bacterium from a microbial consortium. Biodegradation 20, 789-800, 2009 SPRINGER
2. Chocarro-Calvo et al. La expresión del péptido insulinotrópico dependiente de glucosa (GIP) se induce sinérgicamente por insulina y glucosa en células entero endocrinas.Endocrinología y Nutrición, 2009. Mayo.: 56(especial congreso): 7
3. García-Martínez J.Met al. Transcriptional regulation of glucose dependent insulinotrópico peptide.Endocrinología & Metabología, 2009. 52, Suplemento 6 (II): 926
4. García-Redondo AB, et al. Losartan and tempol treatments normalize the increased response to hydrogenperoxide in resistance arteries from hypertensive rats. J Hypertens. 2009 Sep;27(9):1814-22.
5. Briones AM, et al. Atorvastatin prevents angiotensin II-induced vascular remodeling and oxidative stress. Hypertension. 2009 Jul;54(1):142-9.
6. Beltrán AE, et al. p38 MAPK contributes to angiotensin II-induced COX-2 expression in aortic fibroblasts from normotensive and hypertensive rats. J Hypertens. 2009 Jan;27(1):142-54.
7. Briones AM, et al. Activation of BK. Ca channels by nitric oxide prevents coronary artery endothelial dysfunction in ouabain-induced hypertensive rats. J Hypertens. 2009 Jan;27(1):83-91.
8. García-Redondo AB, et al. Hypertension increases contractile responses to hydrogen peroxide in resistance arteries through increased thromboxane A2, Ca2+, and superoxide anion levels. J Pharmacol Exp Ther. 2009, Jan;328(1):19-27.
9. Carrascosa JM, et al. Changes in the neuroendocrine control of energy homeostasis by adiposity signals during aging. Exp Gerontol: 44(1-2): 20-25 (2009)
10. Bonzón-Kulichenko E, et al. Central leptin regulates total ceramide content and srebp-1c proteolytic maturation in rat white adipose tissue. Endocrinology 150(1): 169-178 (2009)
11. García-Martínez, JM., et al. 2009. WNT/beta-catenin increases the production of incretins by entero-endocrine cells. Diabetologia 2009. 52:1913-1924. DOI 10.1007/s00125-009-1429-1.
12. Wagemakers, et al.Entraining synthetic genetic oscillators: Chaos 19 (2009): 033139
13. González-Rodríguez et al. Inhibition of PTP1B restores IRS1-mediated hepatic insulin signaling in IRS2-deficient mice. Diabetes. 2010 Mar;59(3):588-99. Epub 2009 Dec 22