INFRAESTRUCTURAS Y SERVICIOS DISPONIBLES EN CADA CENTRO PARTICIPANTE

Servicios:

• El Centro de Apoyo Tecnológico de la Universidad Rey Juan Carlos (URJC) es una unidad administrativa y de gestión dependiente del Vicerrectorado competente en materia de investigación, cuya finalidad fundamental es dar soporte científico y tecnológico a las necesidades de Investigación y de Formación práctica de la URJC y, en segunda instancia, de su entorno socioeconómico.



• Unidad de Genómica y Citometría de Flujo es uno de los servicios centrales del Centro de Apoyo Tecnológico (CAT) de la URJC. Tiene como objetivo ofrecer tanto a grupos de investigación de la propia URJC como a otros usuarios externos un apoyo en sus proyectos de investigación dentro del campo de la Genómica. El acceso a la solicitud de servicios de la Unidad se hace a través de la herramienta informática Servilims que se podrá encontrar en la página web del CAT.



• Unidad de Microscopía Electrónica: – ver Ficha Microscopia de Electrónica/Barrido - PDF



• Animalario – Unidad de Veterinaria: – ver Ficha Unidad de Veterinaria - PDF
  Estabulación de animales y Sistema integral de monitorización para animales de laboratorio o CLAMS para la ingesta de alimentos, preferencias alimenticias, peso corporal, gasto de energía y calorimetría indirecta, así como para estudios de actividad y parámetros bioquímicos.



• Labotarorio LAFEMEX: (Registro REDLabu nº 400)
  El Laboratorio de Fenotipado Metabólico de Animales de Experimentación (LAFEMEX), dirigido por Dra Gema Medina Gómez, ofrece servicios de caracterización de enfermedades metabólicas en modelos murinos, tanto in vivo como ex vivo, así como fenotipado molecular. Sus objetivos son fomentar la investigación científica, desarrollar instalaciones autosuficientes con un modelo de negocio de recuperación de costos, atraer programas de investigación financiados, y capacitar a investigadores en enfoques estandarizados del metabolismo murino. El laboratorio cuenta con instalaciones especializadas para proporcionar un fenotipado metabólico avanzado, incluyendo monitorización integral de animales de laboratorio para evaluar la ingesta de alimentos, preferencias alimenticias, peso corporal, gasto de energía, calorimetría indirecta y pruebas de tolerancia a la glucosa e insulina.
  Equipos disponibles:
  • Bioplex
  • Glucosimetro
  • Tubos de rayos X intradental

Servicios:

• Laboratorio de Metabolómica (CEMBIO).
  

  El laboratorio de Metabolómica está equipado con equipos de alta resolución, de cromatografía de líquidos, cromatografía de gases y electroforesis capilar con detectores de espectrometría de masas, la mayoría de masa exacta, y sistemas de alimentación SAI independiente. El laboratorio de Metabolómica es el laboratorio de la REDLAB número 260 y forma parte de los Servicios de Apoyo de la Universidad San Pablo CEU ofreciendo sus servicios a grupos de investigación internos y externos.

Instrumentación:

• Liquid Chromatography – Quadrupole – Time of Flight Mass Spectrometer (LC/Q-TOF-MS)




• Liquid Chromatography – Triple Quadrupole Mass Spectrometer (LC/QqQ-MS)




• Dos equipos 1290 Infinity II LC acoplado a sistema 6545/6546 Q-TOF LC/MS para llevar a cabo análisis metabolómico no dirigido permitiendo la elucidación estructural en cualquier tipo de muestra y para una gran variedad de metabolitos utilizando diferentes métodos de LC.




• Sistema LC 1260 acoplado a 6470 Triple Quad LC/MS.




• Sistema versátil 1290 Infinity acoplado a 6460 Triple Quad LC/MS.




• Sistema versátil 1290 Infinity acoplado a 6495 Triple Quad LC/MS, bioinerte.




• Diferentes métodos cromatográficos pueden realizarse para la separación de compuestos con diferentes propiedades químicas en análisis metabolómico dirigido con la mejor sensibilidad y selectividad.




• Gas Chromatography – Quadrupole – Time of Flight Mass Spectrometry (GC/Q-TOF-MS)




• Equipo 7890B GC System acoplado al sistema 7250 Accurate Mass Q-TOF GC/MS con inyección automática de muestras. Permite el análisis metabolómico no dirigido y la elucidación estructural de compuestos polares y apolares en una gran variedad de muestras, como plasma, suero, orina, cerebro, hígado, pulmón, células, entre otros.




• Equipo 8890 GC System acoplado al espectrómetro de masas 5977B GC/MSD con un single cuadrupolo y un autosampler 7693A para 150 muestras que permite la determinación y cuantificación de compuestos polares y apolares en cualquier tipo de muestra. Este sistema puede usarse tanto para el análisis metabolómico dirigido como no dirigido. Está acoplado a un robot de preparación de muestras MPS de Gerstel dotado de un equipo de microextracción en fase sólida, SPME, para el análisis de compuestos orgánicos volátiles (VOCs).




• Capillary Electrophoresis – Time of Flight Mass Spectrometry (CE/TOF-MS)




• Dos sistemas 7100 de Capillary electrophoresis (electroforesis capilar) acoplados a los detectores 6224 TOF MS y 6230 TOF MS para análisis metabolómico no dirigido y separación con gran resolución de compuestos ionizables en diversos tipos de muestras biológicas, con gran precisión de masa y sensibilidad.

Preparación de muestras

El laboratorio de preparación de muestras dispone de la infraestructura necesaria para el tratamiento de gran variedad de muestras de origen biológico antes del análisis metabolómico multiplatarforma pertinente: balanzas analíticas, agitadores magnéticos, baños ultrasonidos, sondas de ultrasonido, centrífugas, ultracentrífugas, criomorteros, homogenizador de tejidos (TissueLyser LT), liofilizador (oolSafe Pro 110-4 Freeze Dryer) y speedvac (HyperVAC model VC2124 centrifuge vacuum concentrator y Savant SPD121P Speed Vac).

El CEMBIO posee experiencia en el análisis de todo tipo de muestras de origen biológico, como resultado de múltiples colaboraciones y análisis realizados para contrataciones externas. Se dispone de protocolos robustos de preparación de muestra y análisis para distintos biofluidos (plasma, suero, orina), heces, muestras de tejidos (adiposo, riñón, hígado, pulmón, cerebro) muestras procedentes de cultivos celulares, así como muestras de origen vegetal (frutos, hojas, y otras partes de las plantas).

Tratamiento de datos

La metabolómica, el estudio de moléculas pequeñas en un organismo está asociado al estudio de rutas metabólicas, y es un nexo entre el genotipo y el fenotipo. En el análisis metabolómico se genera una gran y compleja cantidad de datos. Es por ello que se necesitan herramientas para el análisis de datos para extraer la información biológica relevante. Entre las herramientas utilizadas se incluyen tanto software de código abierto (o herramientas online propias como CEU Mass Mediator) como con licencia: Mass Hunter Qualitative 10.0; Mass Hunter Quantitative; Mass Hunter Profinder 10.0; Unknowns Analysis; Lipid Annotator; Simca P+; MATLAB; MetaCore.

Específicamente CEU Mass Mediator es una herramienta creada en el grupo para la búsqueda de metabolitos en diferentes bases de datos (KEGG, HMBD, LipidMaps, Metlin, MINE y en librería interna). Está específicamente diseñado para el uso de las masas experimentales que se obtienen de un análisis con las técnicas acopladas a espectrometría de masas.

CEU Mass Mediator unifica los compuestos encontrados en diferentes fuentes basándose en InChI Key. Ahorra tiempo a los investigadores que tienen que encontrar los compuestos en las bases de datos uno por uno y unificarlos manualmente, además de reducir el riesgo de una unificación manual incorrecta.

Como parte de nuestro trabajo en investigación, se discuten y se aplican las diferentes herramientas disponibles para el análisis de datos, se lleva a cabo la identificación de metabolitos y se participa en la interpretación biológica de los datos obtenidos.

• Farmacología experimental (SAI-SFT) / Laboratorio de Farmacología.
• Unidad para el análisis del Metabolismo y la Composición Corporal [SAI-UD. METAB).
• Difracción de Rayos X y Microscopía electrónica de Barrido (SAI-DRX-MEB).
• Unidad de Espectrometría de Masas (SAI-SEM).
• Resonancia Magnética Nuclear (SAI-RMN).
• Microscopia Confocal - (SAI-Microcon).

Servicios:

• Servicio de Imagen y Espectroscopía por Resonancia Magnética de Alto Campo – SIERMAC.


• Servicio de Genómica.


• Servicio de Radioprotección.


• Servicio de Histología.


• Servicio de microscopia y confocal.


• Servicio de Imagen Científica.


• Servicio de Calorimetría indirecta.


• Servicio de Evaluación Neurofuncional No Invasiva (NINE).


• RMN Biomédica Sebastián Cerdán.

Servicios:

• Los Centros de Asistencia a la Investigación (CAI) ofrecen apoyo técnico y científico destinados a mejorar las infraestructuras de los investigadores, facilitar el desarrollo de sus Proyectos y ofrecer asesoramiento. Ello va dirigido tanto al personal de la UCM como al de otros entes públicos y privados.



• ICTS Bioimagen Complutense, BIOMAC es una Instalación Científico-Técnica Singular que ofrece servicios de imagen biológica avanzada (anatómica, funcional y molecular) en los campos de la Resonancia Magnética Nuclear (NMR), y la Tomografía por Emisión de Positrones (PET) junto con la Tomografía Axial Computerizada (CT).
  • Espectroscopía de muestras semisólidas (tejidos, alimentos y otros)
  • Imagen de resonancia magnética preclínica
  • Imagen molecular preclínica
  • Imagen Veterinaria
  • Radiotrazadores



• CAI Técnicas Biológicas: compuesta por medios técnicos y humanos que aseguran a los investigadores, y los de cualquier otra Institución pública o privada, la posibilidad de investigar en Biología y Biomedicina.
  • Unidad de Genómica
  • Unidad de Proteómica.
  • Unidad de Citometría de Flujo y Microscopia de Fluorescencia.



• CAI de Técnicas Químicas: compuesto por Unidades especializadas que en su conjunto ofrecen un amplio rango de servicios en diferentes técnicas químicas.
  • Unidad de difracción de Rayos X
  • Unidad de Espectrometría de Masas



• Talleres de Apoyo a la Investigación:
  • Para diseñar, construir y modificar piezas y accesorios de aparatos científicos.
  • Revisión y reparación de equipos de laboratorio.



• Animalario de la UCM:
  • Centro de cría, suministro y uso de animales de experimentación.

Unidades Técnicas:

• Unidad de Medicina Comparada: 17200 jaulas para roedores, 1300 tanques para pez cebra, jaulas para 180 conejos y 36 de cerdos. Las instalaciones para animal grande están dotadas de quirófano, laboratorios de cateterismo y sistema Langendorf para corazones de cerdo.



• Unidad de Imagen Avanzada: MRI, CT y PET, con laboratorios de química orgánica y radiosíntesis para agentes de contraste multimodales / nanosistemas y 2 plataformas para microscopía intravital en roedores. Equipos para animal pequeño (7T MR de campo alto, nano PET / CT, ultrasonido, IVIS, FMT), animal grande (3T MRI, PET / CT, ultrasonido y OCT) y humanos (PET / MRI híbrido, CT de 256 filas exploración y ultrasonido).



• Unidad de Genómica: Equipado con 3 instrumentos Illumina NGS: HiSeq2500, GAIIx y MiSeq. Investigación innovadora sobre genómica unicelular utilizando sistema microfluídico C1 Single-Cell Auto Prep de Fluidigm. 10Xgenomics.



• Unidad de Citometría de Flujo: 3 citómetros de flujo de última generación; 3 clasificadores de alta velocidad; clasificador magnético automatizado; estación de trabajo para manejo de líquidos; microscopio confocal automatizado.



• Unidad de Vectores Virales: Unidad especializada en vectores virales recombinantes (lentivirus y AAV).



• Unidad de Proteómica: Análisis, identificación, cuantificación y caracterización de proteínas utilizando espectrómetros de masas de última generación (QTRAP LC / MS / MS; Orbitrap XL ETD Hybrid Ion Trap-Orbitrap; Orbitrap Elite Hybrid Ion Trap-Orbitrap; Q Exactive Hybrid Quadrupole-Orbitrap; Orbitrap Fusion Cuadrupolo iónico trampa trampa-órbita), y 2 clústeres de alto rendimiento HP Proliant DL980.



• Unidad de Microscopía: Microscopios con fuentes de excitación multiphoton y detectores FLIM (Zeiss 780, ISS-ALBA); Super-resolución super-continuo gSTED-3X y dSTORM; TIRF multicolor; 4 microscopios confocales multilínea de última generación; 4 microscopios de campo amplio / brillante.



• Unidad de Bioinformática: Análisis de datos de alto rendimiento: 2 Clusters de alto rendimiento (HPC), uno con> 1600 hilos y 4.5TB RAM y un segundo HPC para Galaxy Portal con 120 hilos y 0.5TB RAM.



• Unidad de Tecnología de Células Pluripotentes: manipulación, modificación genética y diferenciación de células madre pluripotentes humanas y de ratón con 2 salas de cultivo especializadas.



• Unidad de Transgénesis: Producción de ratones genéticamente modificados, con 2 sets de microinyección de última generación; 4 estereomicroscopios (1 con fluorescencia); sistema de ablación láser; 2 microforges; electroporador biocongelador programable; 4 incubadoras de CO2 / O2, una para fertilización in vitro.